Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ccl20O89093 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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