Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ssxa1B1AUS7 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms