Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Q3U6N9 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Q3U6N9 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Q3U6N9 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Q3U6N9 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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