Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd13P70217 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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