Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
P18530 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
P18530 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
P18530 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
P18530 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P18530 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P18530 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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