Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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