Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Col5a3Q9JLI2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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