Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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