Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms