Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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