Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Rbm43-202ENSMUST00000102768 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm13302-201ENSMUST00000119405 1849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prss35-202ENSMUST00000179574 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Dcaf11-201ENSMUST00000072530 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Nron-203ENSMUST00000156297 3340 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Nek10-203ENSMUST00000112631 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Cdk16-202ENSMUST00000115364 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm7882-201ENSMUST00000177915 1762 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Dgcr2-202ENSMUST00000066127 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sox12Q04890 Gm34424-202ENSMUST00000214104 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sox12Q04890 Gm13571-202ENSMUST00000151984 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sox12Q04890 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sox12Q04890 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sox12Q04890 Sp100-202ENSMUST00000066427 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms