Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprmP28828 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprmP28828 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms