Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Pde6aP27664 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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