Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfrbP05622 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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