Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Col5a3Q9JLI2 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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