Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Csmd1Q923L3 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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