Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Hsd17b7-201ENSMUST00000027989 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24985-201ENSMUST00000104455 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm12079-201ENSMUST00000112483 244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm37619-201ENSMUST00000193219 724 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Olfr326-ps1-201ENSMUST00000204790 392 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Psenen-202ENSMUST00000207031 316 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 1700016J18Rik-201ENSMUST00000214172 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 4933407I05Rik-203ENSMUST00000214646 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Sftpc-201ENSMUST00000022692 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm8366-201ENSMUST00000118751 1769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm8346-201ENSMUST00000178968 1769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Pfkfb2-213ENSMUST00000191347 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Abhd3-201ENSMUST00000002549 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Melk-201ENSMUST00000045607 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Chid1-201ENSMUST00000026586 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Kpna7-201ENSMUST00000110672 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Rap1gds1-209ENSMUST00000200396 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Duxbl3-202ENSMUST00000112340 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Duxbl2-202ENSMUST00000172038 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Epb41-205ENSMUST00000105972 2577 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm39094-202ENSMUST00000206679 624 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm5737-201ENSMUST00000208668 1272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Prokr2-203ENSMUST00000110157 4005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm15931-201ENSMUST00000118066 1852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm20548-205ENSMUST00000174864 787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chic1Q8CBW7 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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