Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Pkp1P97350 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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