Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtpraP18052 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms