Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top3bQ9Z321 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top3bQ9Z321 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms