Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CcniQ9Z2V9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcniQ9Z2V9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms