Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms