Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf1Q9Z1B8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf1Q9Z1B8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms