Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema4fQ9Z123 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema4fQ9Z123 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms