Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl8Q9Z121 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl8Q9Z121 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms