Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmg20bQ9Z104 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmg20bQ9Z104 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms