Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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AireQ9Z0E3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AireQ9Z0E3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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