Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1a4Q9WV27 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1a4Q9WV27 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms