Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Opn3Q9WUK7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Opn3Q9WUK7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Opn3Q9WUK7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Opn3Q9WUK7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Opn3Q9WUK7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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