Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTZ1

Rnf7, RING-box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf7Q9WTZ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf7Q9WTZ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms