Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd7Q9WTY1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd7Q9WTY1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms