Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skp1Q9WTX5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skp1Q9WTX5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms