Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema6cQ9WTM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6cQ9WTM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms