Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Psmb3Q9R1P1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb3Q9R1P1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms