Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma4Q9R1P0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms