Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms