Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ntn3Q9R1A3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ntn3Q9R1A3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms