Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt6Q9R0N8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt6Q9R0N8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms