Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmfrQ9R049 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmfrQ9R049 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms