Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clcf1Q9QZM3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms