Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc3Q9QZC1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trpc3Q9QZC1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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