Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr4a3Q9QZB6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a3Q9QZB6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms