Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Exo1Q9QZ11 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo1Q9QZ11 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms