Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cml5Q9QXS8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms