Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt17Q9QWL7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krt17Q9QWL7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms