Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr4Q9QUK6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr4Q9QUK6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms