Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rabgef1Q9JM13 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rabgef1Q9JM13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rabgef1Q9JM13 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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