Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc4apQ9JLV2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc4apQ9JLV2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc4apQ9JLV2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc4apQ9JLV2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc4apQ9JLV2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms