Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Tmod4Q9JLH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Tmod4Q9JLH8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Tmod4Q9JLH8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Tmod4Q9JLH8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod4Q9JLH8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Tmod4Q9JLH8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms