Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms